ウィンドウの「標準時」の大きさを取得するAPI。

最大化してたり最小化してたりするのに惑わされずに済みます。
これで取得した位置をリストアするときはForm.Locationに代入すると良いです。

using System.Drawing;
using System.Runtime.InteropServices;
using System.Windows.Forms;

namespace Std
{
    static partial class WinForms
    {
        /// <summary>
        /// ウィンドウの標準時の大きさを取得します。
        /// </summary>
        /// <param name="form">取得する元のウィンドウ</param>
        /// <returns>標準時のサイズ</returns>
        public static Rectangle GetNormalWindowLocation(Form form)
        {
            //WinAPI GetWindowPlacement関数を使うと、ウィンドウの状態に関係なく、
            //「通常時」のウィンドウのサイズを取得できます。
            WINDOWPLACEMENT wndpl = new WINDOWPLACEMENT();
            wndpl.Length = Marshal.SizeOf(wndpl);
            GetWindowPlacement((int)form.Handle, ref wndpl);
            return new System.Drawing.Rectangle(
                wndpl.rcNormalPosition.left,
                wndpl.rcNormalPosition.top,
                wndpl.rcNormalPosition.right - wndpl.rcNormalPosition.left,
                wndpl.rcNormalPosition.bottom - wndpl.rcNormalPosition.top);
        }

        [StructLayout(LayoutKind.Sequential)]
        public struct POINT
        {
            public int x, y;
            public POINT(int x, int y) { this.x = x; this.y = y; }
        }

        [StructLayout(LayoutKind.Sequential)]
        public struct RECT
        {
            public int left; public int top; public int right; public int bottom;
            public RECT(int left, int top, int right, int bottom) { this.left = left; this.top = top; this.right = right; this.bottom = bottom; }
        }

        [StructLayout(LayoutKind.Sequential)]
        struct WINDOWPLACEMENT { public int Length; public int flags; public int showCmd; public POINT ptMinPosition; public POINT ptMaxPosition; public RECT rcNormalPosition; }

        [DllImport("user32.dll")]
        extern static bool GetWindowPlacement(int hWnd, ref WINDOWPLACEMENT lpwndpl);

    }
}